We use cookies to ensure you get the best experience on our website
Головна сторінка Огляд Довідка News
Реєстрація Увійти
Aswendt_Lab
/
2024_Ruthe_SND
8
0
Відгалуження 0
Файли Проблеми 0 Запити на злиття 0 Wiki
Дерево: 0332ba78b3
Гілки Теги
2024_Ruthe_SND
/
code
arefks 2e82796756 added viraltracin 2 mtpl space filp function 6 місяців тому
..
.ipynb_checkpoints e8e54e0207 current state: code is finished for representation 7 місяців тому
AIDAmri @ 8e7f9d3597 13cb663094 added all of the code necessery 7 місяців тому
mouse_connectivity e8e54e0207 current state: code is finished for representation 7 місяців тому
Big_data_mouse_practical_2020_answer.ipynb e8e54e0207 current state: code is finished for representation 7 місяців тому
GetQuantitativeValues.py 71bbf47330 corrected bugs 6 місяців тому
ProofOfModalities.py 2e82796756 added viraltracin 2 mtpl space filp function 6 місяців тому
README.md 13cb663094 added all of the code necessery 7 місяців тому
mask2MTPL.py 13cb663094 added all of the code necessery 7 місяців тому
overlayPlot.py 86fce3a119 current state: code is finished for representation 7 місяців тому
overlayPlot3D.py 13cb663094 added all of the code necessery 7 місяців тому
register_masks.py ca2cbb7a6e adjusted code 7 місяців тому
viralTracing2MTPL.py 2e82796756 added viraltracin 2 mtpl space filp function 6 місяців тому

README.md

AIDAmri code

This is the code used to process raw Bruker data and to apply transformations from the drawn masks to each individual subject. Note that this is a subdataset linked to the GitHub page of AIDAmri.

The link to the exact branch of the code which was used for this process is: AIDAmri - SND_Mask_trafu branch.

Example usage of code

root@9c22c56092e5:/aida/DATA/code# python mask2MTPL.py -i /aida/DATA/output/Tract_Density -o /aida/DATA/output/Nifti_Tract_density_registered