arefks 2e82796756 added viraltracin 2 mtpl space filp function před 6 měsíci
..
.ipynb_checkpoints e8e54e0207 current state: code is finished for representation před 7 měsíci
AIDAmri @ 8e7f9d3597 13cb663094 added all of the code necessery před 7 měsíci
mouse_connectivity e8e54e0207 current state: code is finished for representation před 7 měsíci
Big_data_mouse_practical_2020_answer.ipynb e8e54e0207 current state: code is finished for representation před 7 měsíci
GetQuantitativeValues.py 71bbf47330 corrected bugs před 6 měsíci
ProofOfModalities.py 2e82796756 added viraltracin 2 mtpl space filp function před 6 měsíci
README.md 13cb663094 added all of the code necessery před 7 měsíci
mask2MTPL.py 13cb663094 added all of the code necessery před 7 měsíci
overlayPlot.py 86fce3a119 current state: code is finished for representation před 7 měsíci
overlayPlot3D.py 13cb663094 added all of the code necessery před 7 měsíci
register_masks.py ca2cbb7a6e adjusted code před 7 měsíci
viralTracing2MTPL.py 2e82796756 added viraltracin 2 mtpl space filp function před 6 měsíci

README.md

AIDAmri code

This is the code used to process raw Bruker data and to apply transformations from the drawn masks to each individual subject. Note that this is a subdataset linked to the GitHub page of AIDAmri.

The link to the exact branch of the code which was used for this process is: AIDAmri - SND_Mask_trafu branch.

Example usage of code

root@9c22c56092e5:/aida/DATA/code# python mask2MTPL.py -i /aida/DATA/output/Tract_Density -o /aida/DATA/output/Nifti_Tract_density_registered