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Rama: master
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Christian O. Häusler 0b3aab1003 add python 3.7 venv hace 8 meses
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__pycache__ 537ec90433 add scripts for t-test of correlations hace 2 años
localpython 0b3aab1003 add python 3.7 venv hace 8 meses
.gitattributes 9487e4872a Apply YODA dataset setup hace 3 años
README.md 916574e9ea Apply YODA dataset setup hace 3 años
corrstats.py 537ec90433 add scripts for t-test of correlations hace 2 años
create-roi-overlaps.sh 67142e8c54 add script to create union of visual rois (Sengupta et al., 2016) hace 3 años
data_mask_concat_jobs.sh b8e355a338 change datalad run message hace 1 año
data_mask_concat_runs.py d95905c64f refactoring of preprocessing script v2 hace 1 año
data_mask_concat_runs.submit adfa33637d add scripts to send masks & concats 4D data to HTcondor hace 3 años
data_srm_fitting.py e7ddf0f651 adjust scripts to not write to test directory hace 10 meses
data_srm_fitting.submit e7ddf0f651 adjust scripts to not write to test directory hace 10 meses
data_srm_fitting_venv.sh e7ddf0f651 adjust scripts to not write to test directory hace 10 meses
get_wmatrix_for_left-out.py e886d0b7ad clean scripts to be run on a cluster hace 1 año
get_wmatrix_for_left-out.submit e7ddf0f651 adjust scripts to not write to test directory hace 10 meses
get_wmatrix_for_left-out_venv.sh e7ddf0f651 adjust scripts to not write to test directory hace 10 meses
grand_mean_for_4d.py aaeab67c35 save normalized runs (AV, AO, VIS) per subject hace 2 años
grand_mean_for_4d.submit 4da9abe9b2 rename to grand_mean_for_4d hace 2 años
masks-builder-voxel-counter.py c281121e32 update masks-builder-voxel-counter.py hace 3 años
masks-from-mni-to-bold3Tp2.py 34de58345d some revision of parameters & pathes in scripts hace 2 años
masks-from-t1w-to-bold3Tp2.py ef39ea4539 update masks-from-t1w-to-bold3Tp2.py hace 3 años
plot_bland-altman.py 671d4787bb add script for plotting stripplot of correlations hace 2 años
plot_corr-emp-vs-estimation.py 135d832fb1 ouput plots only as pdf hace 10 meses
plot_corr-of-glm-and-srm.py 135d832fb1 ouput plots only as pdf hace 10 meses
plot_cronbachs.py 135d832fb1 ouput plots only as pdf hace 10 meses
plot_srm.py 135d832fb1 ouput plots only as pdf hace 10 meses
plot_voxel-counts.py 135d832fb1 ouput plots only as pdf hace 10 meses
predict_ppa.py 11ffb9fdc4 allow to speak of minutes (and not just TRs) hace 1 año
predict_ppa.submit e7ddf0f651 adjust scripts to not write to test directory hace 10 meses
predict_ppa_other-nfeat.submit 6a1dd968b8 allow plotting of non-5-dimensional CFSs results hace 10 meses
predict_ppa_venv.sh 657713c779 set FSL variables hace 10 meses
statistics_cronbachs.py e7ddf0f651 adjust scripts to not write to test directory hace 10 meses
statistics_t-test-correlations.py e7ddf0f651 adjust scripts to not write to test directory hace 10 meses

README.md

All custom code goes into this directory. All scripts should be written such that they can be executed from the root of the dataset, and are only using relative paths for portability.