Thalamic bursts modulate cortical synchrony locally to switch
between states of global functional connectivity in a cognitive task

Oscar Portoles 870a63ef6e Update 'README.md' 3 роки тому
data 438d770171 Upload files to 'data' 3 роки тому
hsmm 1f95ce5fb3 Upload files to 'hsmm' 3 роки тому
LICENSE 4964b196b4 Initial commit 3 роки тому
README.md 870a63ef6e Update 'README.md' 3 роки тому
ROIrelevance.py 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
acrossTrialFCandEnvelopeFig.m 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
durationProcStages.m 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
files4brainNetViewer.py 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
findBoundsProcesStages.m 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
findInitailCond.py 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
getERP_SUBJwindow.m 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
gridSearch_G_L.py 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
metaAfterTask.py 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
modelStages.py 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
nodeRelvance4figure.ipynb 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
optimizationProcesses.py 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
relvaneOfPulses.py c08c21a3e6 Upload files to '' 3 роки тому
reproduce_Figs.ipynb 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
reproduce_SI_fig.ipynb 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
runOptimization.py 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
thresholdPLIbysurro.m 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
vis1ERPFCwindows.m 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
visArchis_seq.py c08c21a3e6 Upload files to '' 3 роки тому
visERPwindows.m 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
withinStagePLI.m 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому
withinStagePLIsurrogate.m 726d09c004 Upload files to '' 3 роки тому

README.md

SwitchingFCalongAtask

Thalamic bursts modulate cortical synchrony locally to switch between states of global functional connectivity in a cognitive task

To reproduce the figures in teh paper follow the Jupyter notebooks

MEG data was processed with Matlab.

Simulations were performed with Python 3.6

Python Dependencies

  • numpy
  • scipy
  • pygmo version >= 2.15
  • numba verson >= 0.47
  • matplotlib
  • statsmodels