doi/natfeedback_code_eLife: Data and code for "Robust effects of corticothalamic feedback and behavioral state on movie responses in mouse dLGN" @ synced/master

Martin Spacek e15e47543b Update README.md, add /csv, /pickles and /stats README.md files		před 2 roky
..
negntsrmvis	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
ntsrmvis	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
README.md	e15e47543b Update README.md, add /csv, /pickles and /stats README.md files	před 2 roky
bestgrtresp.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
bestmviresp.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
cellscreenpos.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
celltype.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
fig1.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
fig1S33S1.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
fig2.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
fig3.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
fig4.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
fig5.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
fig5S2.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
fig6.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
fits.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
grtFMI.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
grtRMI.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
grtmseustrs.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
grtresp.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
grttunresp.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
ipos_opto.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
ipos_st8.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
iposmi.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
maxFMI.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
maxRMI.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
mviFMI.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
mviRMI.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
mvigrtmsustrs.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
mvimseustrs.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
mviresp.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
runspeed.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
sampfits.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
sponresp.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky
upos.pickle	1c15e1f2f2 Initial commit copied over from natfeedback_code 2022-02-07 rev 9eabb0	před 2 roky

These are Python3 pickles of pandas DataFrames or lists of Python strings which locally store all relevant data.

datacite.yml
Title	Robust effects of corticothalamic feedback and behavioral state on movie responses in mouse dLGN
Authors	Spacek,Martin;LMU Munich;0000-0002-9519-3284 Crombie,Davide;LMU Munich;0000-0003-3424-3249 Bauer,Yannik;LMU Munich;0000-0003-2613-6443 Born,Gergory;LMU Munich;0000-0003-0430-3052 Liu,Xinyu;LMU Munich;0000-0002-3527-6168 Katzner,Steffen;LMU Munich;0000-0002-4424-2197 Busse,Laura;LMU Munich;0000-0002-6127-7754
Description	Data and Python code for regenerating plots in Spacek et. al., 2022, published in eLife (https://doi.org/10.7554/eLife.70469). Use `main.py` to load data for all LGN optogenetic experiments as a function of stimulus type (movies, gratings), run state, and opto state. Data are loaded from pandas DataFrames, which are saved as Python pickles. Statistics are computed using the included R code.
License	Creative Commons Attribution 4.0 International Public License (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)
References	Spacek, M. A., Crombie, D., Bauer, Y., Born, G., Liu, X., Katzner, S., Busse, L. Robust effects of corticothalamic feedback and behavioral state on movie responses in mouse dLGN. eLife 11:e70469 (2022) [doi:10.7554/eLife.70469] (IsSupplementTo)
Funding	DFG, SFB 1233 TP 13, project number 276693517 DFG, SFB 870 TP 19, project number 118803580 DFG, BU 1808/5-1 Joachim Herz Stiftung (Joachim Herz Foundation)
Keywords	lateral geniculate nucleus corticothalamic feedback naturalistic movies locomotion pupil dilation firing mode
Resource Type	Dataset

README.md