We use cookies to ensure you get the best experience on our website
Головна сторінка Огляд Довідка News
Реєстрація Увійти
Aswendt_Lab
/
2024_Ruthe_SND
8
0
Відгалуження 0
Файли Проблеми 0 Запити на злиття 0 Wiki
Дерево: 9a03b69e66
Гілки Теги
2024_Ruthe_SND
/
output
arefks 9a03b69e66 same as density masks also performed the regaladin here for the adjusted binary masks, this was the second version where the masks are dialated a littel bit 9 місяців тому
..
4Presentation f74625b3cc data used for presentation 9 місяців тому
Nifti_Tract_density_registered 025bfd6626 perfored regaladin to get the tract desnity maps in the same orientaion and resolution of the MTPL or the iso_registered.nii.gz file 9 місяців тому
Nifti_Trakte e8e54e0207 current state: code is finished for representation 9 місяців тому
Nifti_Trakte_V2 8ae1cd122e updated tracts 9 місяців тому
Nifti_Trakte_registered e8e54e0207 current state: code is finished for representation 9 місяців тому
Nifti_Trakte_registered_v2 9a03b69e66 same as density masks also performed the regaladin here for the adjusted binary masks, this was the second version where the masks are dialated a littel bit 9 місяців тому
Tract_Density fa5effbbd2 I added a tract density folder 9 місяців тому
figures e8e54e0207 current state: code is finished for representation 9 місяців тому
.DS_Store fa5effbbd2 I added a tract density folder 9 місяців тому
C57BL6_mouse.iso_registerd.nii.gz 45782701c4 updated input and output 9 місяців тому
README.md a0f2377f45 I updated the READme file for Outputs 9 місяців тому
affineTrafo.txt 45782701c4 updated input and output 9 місяців тому

README.md

Outputs

  • Nifti_Trakte: Contains all manually drawn masks created with DSI Studio.
  • Nifti_Trakte_registered: Contains the masks registered to our in-house MRI template (MTPL). This registration was performed manually using reg_aladin and reg_resample.
  • affineTrafo.txt: This is the output transformation matrix generated by reg_aladin during the registration of the C57BL6_mouse.iso.nii.gz file to the NP_template_sc0.nii.gz.
  • C57BL6_mouse.iso_registered.nii.gz: This is the output image created by reg_aladin when registering the C57BL6_mouse.iso.nii.gz file to the NP_template_sc0.nii.gz.
  • Nifti_Trakte_V2: These are the updated tracts (NV).
  • Tract_Density: This folder contains the density of each generated tract mask, saved from DSI-Studio.