recon-all.env 4.3 KB

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  1. Sa 29. Nov 08:57:45 CET 2014
  2. FREESURFER_HOME /opt/freesurfer/5.3
  3. Actual FREESURFER_HOME /opt/freesurfer/5.3
  4. /home/data/exppsy/Field_Strength_Comparison/analysis/Freesurfer/sub021
  5. setenv SUBJECTS_DIR /home/data/exppsy/Field_Strength_Comparison/analysis/Freesurfer
  6. -s sub021 -hippo-subfields
  7. Linux medusa 3.2.0-4-amd64 #1 SMP Debian 3.2.60-1+deb7u3 x86_64 GNU/Linux
  8. cputime unlimited
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  14. vmemoryuse 18000000 kbytes
  15. descriptors 1024
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  23. maxrttime unlimited
  24. LC_PAPER=de_DE.UTF-8
  25. MODULE_VERSION_STACK=3.2.10
  26. LC_ADDRESS=de_DE.UTF-8
  27. LC_MONETARY=de_DE.UTF-8
  28. FS_OVERRIDE=0
  29. AFNI_PLUGINPATH=/usr/lib/afni/plugins
  30. SHELL=/bin/bash
  31. TERM=xterm
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  35. FSLMULTIFILEQUIT=TRUE
  36. LC_NUMERIC=de_DE.UTF-8
  37. POSSUMDIR=/usr/share/fsl/5.0
  38. SSH_TTY=/dev/pts/48
  39. OS=Linux
  40. AFNI_TTATLAS_DATASET=/usr/share/afni/atlases
  41. USER=spark
  42. LOCAL_DIR=/opt/freesurfer/5.3/local
  43. LC_TELEPHONE=de_DE.UTF-8
  44. LS_COLORS=rs=0:di=01;34:ln=01;36:mh=00:pi=40;33:so=01;35:do=01;35:bd=40;33;01:cd=40;33;01:or=40;31;01:su=37;41:sg=30;43:ca=30;41:tw=30;42:ow=34;42:st=37;44:ex=01;32:*.tar=01;31:*.tgz=01;31:*.arj=01;31:*.taz=01;31:*.lzh=01;31:*.lzma=01;31:*.tlz=01;31:*.txz=01;31:*.zip=01;31:*.z=01;31:*.Z=01;31:*.dz=01;31:*.gz=01;31:*.lz=01;31:*.xz=01;31:*.bz2=01;31:*.bz=01;31:*.tbz=01;31:*.tbz2=01;31:*.tz=01;31:*.deb=01;31:*.rpm=01;31:*.jar=01;31:*.war=01;31:*.ear=01;31:*.sar=01;31:*.rar=01;31:*.ace=01;31:*.zoo=01;31:*.cpio=01;31:*.7z=01;31:*.rz=01;31:*.jpg=01;35:*.jpeg=01;35:*.gif=01;35:*.bmp=01;35:*.pbm=01;35:*.pgm=01;35:*.ppm=01;35:*.tga=01;35:*.xbm=01;35:*.xpm=01;35:*.tif=01;35:*.tiff=01;35:*.png=01;35:*.svg=01;35:*.svgz=01;35:*.mng=01;35:*.pcx=01;35:*.mov=01;35:*.mpg=01;35:*.mpeg=01;35:*.m2v=01;35:*.mkv=01;35:*.webm=01;35:*.ogm=01;35:*.mp4=01;35:*.m4v=01;35:*.mp4v=01;35:*.vob=01;35:*.qt=01;35:*.nuv=01;35:*.wmv=01;35:*.asf=01;35:*.rm=01;35:*.rmvb=01;35:*.flc=01;35:*.avi=01;35:*.fli=01;35:*.flv=01;35:*.gl=01;35:*.dl=01;35:*.xcf=01;35:*.xwd=01;35:*.yuv=01;35:*.cgm=01;35:*.emf=01;35:*.axv=01;35:*.anx=01;35:*.ogv=01;35:*.ogx=01;35:*.aac=00;36:*.au=00;36:*.flac=00;36:*.mid=00;36:*.midi=00;36:*.mka=00;36:*.mp3=00;36:*.mpc=00;36:*.ogg=00;36:*.ra=00;36:*.wav=00;36:*.axa=00;36:*.oga=00;36:*.spx=00;36:*.xspf=00;36:
  45. LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/fsl/5.0
  46. FSFAST_HOME=/opt/freesurfer/5.3/fsfast
  47. MNI_PERL5LIB=/opt/freesurfer/5.3/mni/lib/perl5/5.8.5
  48. FMRI_ANALYSIS_DIR=/opt/freesurfer/5.3/fsfast
  49. FSF_OUTPUT_FORMAT=nii.gz
  50. AFNI_IMSAVE_WARNINGS=NO
  51. MINC_BIN_DIR=/opt/freesurfer/5.3/mni/bin
  52. SUBJECTS_DIR=/home/data/exppsy/Field_Strength_Comparison/analysis/Freesurfer
  53. PATH=/opt/freesurfer/5.3/bin:/opt/freesurfer/5.3/fsfast/bin:/opt/freesurfer/5.3/tktools:/opt/freesurfer/5.3/mni/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/local/games:/usr/games:/usr/lib/afni/bin:/usr/lib/fsl/5.0
  54. MAIL=/var/mail/spark
  55. MODULE_VERSION=3.2.10
  56. LC_IDENTIFICATION=de_DE.UTF-8
  57. PWD=/home/data/exppsy/Field_Strength_Comparison/analysis/Freesurfer/sub021
  58. FUNCTIONALS_DIR=/opt/freesurfer/5.3/sessions
  59. LANG=C
  60. MODULEPATH=/etc/environment-modules/modules:/usr/share/modules/versions:/usr/Modules/$MODULE_VERSION/modulefiles:/usr/share/modules/modulefiles
  61. FSLTCLSH=/usr/bin/tclsh
  62. LC_MEASUREMENT=de_DE.UTF-8
  63. LOADEDMODULES=
  64. FSLMACHINELIST=
  65. MINC_LIB_DIR=/opt/freesurfer/5.3/mni/lib
  66. FSLREMOTECALL=
  67. FSLWISH=/usr/bin/wish
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  71. LANGUAGE=en_US:en
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  73. FREESURFER_HOME=/opt/freesurfer/5.3
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  76. SSH_CONNECTION=95.91.252.102 10514 141.44.17.54 22
  77. MODULESHOME=/usr/share/modules
  78. FIX_VERTEX_AREA=
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  80. FSLLOCKDIR=
  81. MNI_DATAPATH=/opt/freesurfer/5.3/mni/data
  82. FSLOUTPUTTYPE=NIFTI_GZ
  83. LC_TIME=de_DE.UTF-8
  84. AFNI_MODELPATH=/usr/lib/afni/models
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  86. BASH_FUNC_module()=() { eval `/usr/bin/modulecmd bash $*`
  87. }
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