Wed May 30 14:45:39 CEST 2018 FREESURFER_HOME /pasteur/homes/ntraut/bin/freesurfer-6.0.0 Actual FREESURFER_HOME /pasteur/homes/ntraut/bin/freesurfer-6.0.0 /pasteur/projets/policy01/cinq/rto/data/abide/fs-6.0.0/0050750 setenv SUBJECTS_DIR /pasteur/projets/policy01/cinq/rto/data/abide/fs-6.0.0 -s 0050750 -qcache -measure w-g.pct.mgh Linux tars-203 2.6.32-696.18.7.el6.x86_64 #1 SMP Thu Jan 4 17:31:22 UTC 2018 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux cputime unlimited filesize unlimited datasize unlimited stacksize 10240 kbytes coredumpsize 0 kbytes memoryuse 1048576 kbytes vmemoryuse unlimited descriptors 65536 memorylocked 64 kbytes maxproc 1024 MODULE_VERSION_STACK=3.3 SLURM_NODELIST=tars-203 SLURM_CHECKPOINT_IMAGE_DIR=/var/slurm/checkpoint FSL_BIN=/pasteur/homes/ntraut/bin/fsl-5.0.10/bin 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