{
 "cells": [
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {},
   "source": [
    "# 実験を終了する\n",
    "\n",
    "実験記録をデータガバナンス機能に保存して、実験を終了します。"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {},
   "source": [
    "## 1.実行環境構成を記録する"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": null,
   "metadata": {},
   "outputs": [],
   "source": [
    "%%sh\n",
    "conda env export -n base > ~/environment.yml\n",
    "pip freeze > ~/requirements.txt"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {},
   "source": [
    "## 2. 実験記録をデータガバナンス機能に同期する\n",
    "\n",
    "実験記録をデータガバナンス機能に同期します。  \n",
    "以下のセルを実行してください。\n",
    "\n",
    "※データの保存先としてAWS S3準拠のオブジェクトストレージを利用する場合は、  \n",
    "[こちら](util/operate_S3_annex.ipynb)も併せて実行してください。"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": null,
   "metadata": {},
   "outputs": [],
   "source": [
    "from IPython.display import display, Javascript\n",
    "display(Javascript('IPython.notebook.save_checkpoint();'))"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": null,
   "metadata": {},
   "outputs": [],
   "source": [
    "import os\n",
    "import glob\n",
    "\n",
    "# Git管理のパスのリストを作成する\n",
    "%cd ~/\n",
    "files = os.listdir()\n",
    "# ディレクトリ一覧からGit-annex管理するディレクトリ(input_dataとoutput_data)を排除する\n",
    "dirs = [f for f in files if os.path.isdir(f)]\n",
    "dirs.remove('input_data')\n",
    "dirs.remove('output_data')\n",
    "# HOME直下のファイルを取得\n",
    "files = [f for f in files if os.path.isfile(f)]\n",
    "# Git管理するパスの配列を作成する\n",
    "files.extend(dirs)\n",
    "save_path = files\n",
    "\n",
    "# Git-annex管理するパスの配列を作成する\n",
    "annexed_save_path = ['input_data', 'output_data']"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": null,
   "metadata": {},
   "outputs": [],
   "source": [
    "import papermill as pm\n",
    "\n",
    "%cd ~/\n",
    "# Git-annex管理ファイルを保存\n",
    "pm.execute_notebook(\n",
    "    'EX-WORKFLOW/util/base_datalad_save_push.ipynb',\n",
    "    '/home/jovyan/.local/push_log.ipynb',\n",
    "    parameters = dict(SAVE_MESSAGE = '実験終了 (1/2)', PATH = annexed_save_path, IS_RECURSIVE = False)\n",
    ")"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": null,
   "metadata": {},
   "outputs": [],
   "source": [
    "import papermill as pm\n",
    "\n",
    "%cd ~/\n",
    "# Git管理ファイルを保存\n",
    "pm.execute_notebook(\n",
    "    'EX-WORKFLOW/util/base_datalad_save_push.ipynb',\n",
    "    '/home/jovyan/.local/push_log.ipynb',\n",
    "    parameters = dict(SAVE_MESSAGE = '実験終了 (2/2)', TO_GIT = True, PATH = save_path, IS_RECURSIVE = False)\n",
    ")"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {},
   "source": [
    "## 3. この実験実行環境を停止・削除する\n",
    "\n",
    "コード利用機能を利用している場合、不要になったこの実行環境を停止・削除します。  \n",
    "コード付帯機能では20までしか実行環境を構築できないため、不要な実行環境は削除することを推奨します。"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {},
   "source": [
    "### 3.1 この実行環境を確認する\n",
    "\n",
    "以下のセルを実行して実行環境のサーバー名を確認して下さい。  "
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": null,
   "metadata": {},
   "outputs": [],
   "source": [
    "import os\n",
    "\n",
    "print(os.environ[\"JUPYTERHUB_SERVICE_PREFIX\"].split('/')[3])"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {},
   "source": [
    "### 3.2 コード付帯機能のコントロールパネルへ遷移し、実行環境を停止・削除する\n",
    "\n",
    "[コントロールパネル](https://jupyter.cs.rcos.nii.ac.jp/hub/home)へ遷移して、`4.1`で確認したサーバーを`stop`、`delete`ボタンをクリックして停止・削除してください。  \n",
    "※`delete`ボタンは、以下の図のように`stop`ボタンをクリックした後に表示されます。  \n",
    "![コンテナ削除キャプチャ](https://raw.githubusercontent.com/NII-DG/workflow-template/develop/sections/PACKAGE/base/EX-WORKFLOW/images/%E3%82%B3%E3%83%B3%E3%83%86%E3%83%8A%E5%89%8A%E9%99%A4%E3%82%AD%E3%83%A3%E3%83%97%E3%83%81%E3%83%A3.png)"
   ]
  }
 ],
 "metadata": {
  "kernelspec": {
   "display_name": "Python 3 (ipykernel)",
   "language": "python",
   "name": "python3"
  },
  "language_info": {
   "codemirror_mode": {
    "name": "ipython",
    "version": 3
   },
   "file_extension": ".py",
   "mimetype": "text/x-python",
   "name": "python",
   "nbconvert_exporter": "python",
   "pygments_lexer": "ipython3",
   "version": "3.9.10"
  }
 },
 "nbformat": 4,
 "nbformat_minor": 4
}