AIDAhisto: Atlas-based imaging data analysis tool for mouse brain histology Number of identified Cells 1148 x-y Cell Postitions 309 972 309 1253 311 1261 314 1268 315 1064 315 1244 316 1046 316 1204 317 1240 320 1263 320 1309 321 962 322 1324 324 1064 324 1292 325 1232 325 1391 327 1166 327 1397 328 1345 328 1378 329 964 329 1332 329 1359 329 1436 330 1058 330 1304 330 1411 331 1177 331 1369 332 1161 332 1479 334 1129 334 1495 335 963 336 1046 337 1134 337 1139 337 1226 337 1511 338 977 338 1034 339 970 339 1539 341 1185 341 1198 341 1210 341 1552 344 1026 344 1106 345 1037 346 1000 346 1165 348 1010 348 1077 348 1153 348 1596 350 992 350 1062 350 1589 352 1576 354 1601 356 1033 356 1620 357 1024 358 1520 359 1631 360 982 360 1001 362 1638 366 965 368 1224 370 930 373 1654 375 1387 376 1072 378 1621 381 899 382 1672 385 973 385 1587 386 1231 388 1689 389 1066 395 1272 397 1704 398 840 399 1104 400 870 402 1712 403 933 404 1167 408 1259 415 1737 417 891 421 1632 423 1546 426 841 428 1050 429 1748 430 1105 430 1366 434 1152 437 1758 440 1481 441 1765 447 1559 451 1776 452 954 452 1314 452 1536 454 1785 455 810 455 1129 456 1292 460 1136 462 1289 468 1171 472 1090 476 1321 479 1810 481 785 483 1711 484 1249 490 784 490 1809 494 1819 495 1114 495 1200 496 899 503 1758 514 1019 518 1104 520 1033 521 731 523 1064 523 1144 524 1316 525 1776 527 1785 531 730 532 1256 536 714 537 866 539 1231 541 1373 545 1070 548 1303 552 1873 554 1238 556 1068 559 926 560 1877 564 693 568 1049 572 1433 572 1504 577 1027 582 1081 582 1230 582 1242 584 1108 585 1204 585 1219 587 834 591 1234 592 785 592 1080 593 875 598 1559 606 1742 607 1957 607 1966 608 1233 608 1976 610 1891 611 1918 614 1940 618 1686 620 1485 620 1552 624 1089 624 1970 626 1494 627 1953 630 1218 630 1890 633 1231 637 794 637 1091 639 1105 644 1942 645 613 645 1102 646 1094 647 1039 647 1150 648 1535 650 1604 651 1410 651 2004 652 594 655 1389 658 1768 659 667 659 1169 659 1958 661 1490 665 1982 668 1698 668 1766 669 601 669 993 669 1239 673 1116 674 1261 675 1106 678 1156 679 996 680 1342 681 595 682 602 682 2080 684 866 686 1731 689 651 693 1950 695 603 695 1459 699 586 700 1124 700 1560 702 1552 704 605 705 1948 710 573 713 603 713 1944 718 1996 719 1584 720 599 724 1159 728 1123 728 1814 729 535 736 2008 738 548 740 953 741 1983 744 533 744 1989 745 665 751 1411 755 2009 757 1162 758 594 761 1143 762 539 762 2008 768 1180 770 1133 771 521 771 1627 774 605 774 1638 779 1141 780 549 781 508 785 1436 786 2025 788 803 789 1214 795 1112 795 2016 797 558 800 980 801 1142 803 530 803 2018 806 506 810 2018 811 2002 813 601 813 1140 814 505 815 1249 817 537 820 1662 823 532 823 1998 825 506 825 1317 826 1968 828 1107 832 707 834 513 835 793 837 1106 837 2019 839 490 839 1861 842 524 844 483 844 1035 845 830 847 530 848 776 848 1062 848 1956 851 544 851 1817 853 1532 853 1541 856 477 857 1113 858 619 859 465 859 1357 864 874 866 600 866 779 866 1596 867 490 867 514 868 1574 868 1880 870 529 870 1865 871 470 871 1103 871 1769 872 884 872 1985 873 867 875 1115 876 1006 876 1639 877 484 881 616 883 470 883 1250 884 1120 886 548 887 502 889 535 889 1000 889 2021 891 691 891 1238 894 1092 895 591 895 1705 896 632 897 470 897 814 897 2030 901 994 901 1573 902 521 904 1791 908 506 908 727 911 1118 912 618 912 1585 913 540 913 1646 914 566 914 978 914 2038 918 555 918 638 919 523 919 625 919 643 920 504 922 541 922 1430 923 1733 924 1603 925 613 927 1292 928 563 929 1886 930 515 931 466 932 496 935 485 936 455 937 440 937 519 940 619 941 573 941 865 942 478 942 540 942 1012 948 582 948 691 950 570 950 1636 954 605 957 593 963 1660 966 494 966 773 966 1135 967 1207 969 1787 971 651 972 1261 975 489 975 1057 976 508 976 1099 977 908 979 441 981 495 981 577 985 1161 988 581 989 626 991 508 992 486 992 1113 996 552 996 1596 997 1390 998 514 999 643 999 2026 1002 1328 1002 1814 1003 630 1004 495 1004 638 1008 1132 1008 2020 1010 617 1010 842 1011 512 1012 896 1013 529 1013 1056 1015 1711 1023 473 1023 1216 1024 497 1025 654 1025 1144 1026 582 1028 1846 1029 892 1031 1890 1032 645 1033 421 1033 638 1034 1969 1036 457 1039 432 1039 634 1040 903 1045 633 1047 571 1049 818 1050 1770 1051 1346 1052 425 1053 413 1056 508 1056 1602 1058 447 1062 714 1064 1587 1065 522 1066 2008 1067 1044 1067 1680 1072 1146 1073 1810 1075 465 1076 631 1077 1899 1077 1989 1079 1731 1082 2004 1084 1393 1087 1739 1090 433 1091 464 1092 526 1094 538 1094 588 1096 667 1097 575 1099 834 1101 522 1102 501 1102 923 1102 2003 1103 1734 1104 2011 1106 463 1107 652 1108 1221 1110 1982 1114 651 1115 489 1116 1209 1125 509 1125 1753 1126 576 1128 1694 1131 860 1133 673 1137 503 1137 599 1140 244 1141 1016 1142 1703 1143 1241 1145 1119 1146 727 1146 759 1147 235 1147 1097 1155 358 1156 616 1156 1975 1157 337 1157 1758 1159 587 1163 1922 1164 989 1165 351 1169 545 1169 844 1171 734 1171 1562 1174 996 1174 1304 1175 538 1175 1002 1176 559 1178 329 1178 525 1180 1296 1182 595 1184 1422 1185 567 1188 553 1189 339 1189 1692 1189 1707 1192 955 1196 446 1198 1171 1198 1837 1201 675 1204 441 1209 1785 1210 1353 1215 941 1216 528 1217 1892 1225 706 1226 718 1226 1371 1227 1986 1228 534 1231 1895 1235 1824 1235 1980 1236 644 1238 474 1241 1133 1243 808 1244 228 1244 1839 1249 894 1250 813 1253 1594 1254 1459 1254 1614 1254 1739 1258 1517 1259 1630 1261 1743 1263 1677 1265 759 1267 1044 1269 1191 1277 944 1279 533 1280 771 1281 546 1283 538 1286 1755 1287 558 1288 1254 1289 794 1289 1701 1290 992 1290 1686 1295 971 1295 1557 1298 920 1301 1450 1301 1600 1302 270 1302 1459 1302 1806 1307 1948 1313 843 1315 1166 1315 1847 1320 709 1320 1710 1330 1119 1333 352 1333 743 1333 1948 1338 1913 1340 805 1344 871 1348 976 1348 984 1351 1344 1352 1286 1352 1784 1353 1952 1355 241 1355 1905 1356 986 1357 1488 1358 760 1358 1258 1358 1428 1359 454 1361 226 1363 257 1365 1058 1366 751 1367 1280 1371 1232 1372 1405 1374 947 1376 38 1377 214 1378 1905 1380 1879 1380 1911 1386 1139 1388 981 1389 517 1389 1155 1390 456 1390 1145 1395 1330 1396 229 1397 414 1397 1561 1398 716 1399 34 1403 351 1403 1359 1403 1406 1406 1194 1407 1484 1409 1340 1410 1240 1410 1582 1414 458 1416 1438 1418 1492 1419 1927 1420 1114 1429 1703 1430 1291 1432 1038 1435 1443 1435 1653 1435 1787 1437 564 1439 631 1441 444 1441 687 1442 429 1442 436 1442 1056 1444 1521 1445 695 1445 1671 1446 1640 1450 1445 1453 1530 1453 1603 1454 1222 1457 532 1459 721 1462 1127 1464 1765 1467 1218 1468 1772 1468 1923 1473 1155 1474 1175 1475 850 1475 1069 1475 1186 1477 926 1478 1759 1479 951 1480 1093 1480 1143 1481 1065 1482 977 1483 766 1483 1706 1484 1224 1484 1332 1485 1006 1485 1610 1487 1594 1487 1720 1488 887 1488 894 1488 1805 1488 1927 1490 1798 1491 1782 1493 1465 1494 1155 1496 1107 1498 1403 1499 518 1501 369 1501 1444 1503 499 1503 1347 1506 1907 1507 1073 1507 1091 1510 1923 1513 1917 1520 1541 1522 1900 1527 1076 1529 575 1530 625 1531 1114 1533 1365 1538 1200 1538 1678 1542 410 1543 874 1543 1321 1543 1720 1544 1179 1549 1609 1550 367 1551 1929 1552 1017 1554 362 1555 1499 1558 880 1560 1607 1562 1010 1562 1445 1564 1459 1575 372 1575 668 1575 1542 1576 1206 1576 1563 1580 1649 1581 1463 1584 375 1587 1475 1587 1942 1592 287 1592 1447 1594 1195 1594 1455 1597 296 1597 1748 1597 1954 1599 557 1601 288 1604 1957 1605 1271 1610 1323 1612 293 1615 286 1616 1079 1618 821 1619 1129 1620 899 1624 1416 1627 393 1633 430 1635 370 1635 883 1641 413 1642 361 1644 564 1650 952 1655 1092 1657 367 1659 1759 1660 759 1666 450 1670 1017 1673 486 1676 719 1678 737 1678 1943 1682 808 1682 1499 1684 574 1686 817 1687 1518 1687 1560 1688 619 1688 1468 1695 1096 1695 1976 1698 1647 1701 515 1703 975 1710 753 1711 1455 1712 1645 1714 1972 1715 392 1717 885 1722 743 1723 770 1726 620 1732 1014 1742 1619 1743 1792 1744 1892 1746 793 1752 592 1754 1459 1755 635 1755 1152 1756 622 1757 1899 1760 1058 1761 1225 1764 568 1764 1304 1764 1761 1765 1138 1771 1834 1772 1009 1773 395 1773 1762 1778 482 1783 773 1783 1936 1787 1005 1788 534 1788 573 1788 816 1791 996 1796 1839 1797 1531 1798 417 1798 684 1799 790 1800 608 1802 541 1813 653 1816 687 1818 538 1818 868 1822 750 1825 879 1826 509 1828 705 1835 1518 1837 1648 1840 413 1842 762 1844 1926 1846 1697 1850 810 1853 502 1854 1641 1855 1541 1856 868 1856 897 1858 1264 1859 1751 1863 517 1863 522 1865 1989 1871 668 1872 648 1872 1983 1873 623 1876 559 1877 515 1878 547 1879 1275 1884 825 1884 1418 1890 757 1895 1557 1900 754 1901 1956 1905 736 1905 996 1905 1984 1906 553 1906 804 1907 519 1909 492 1919 458 1925 557 1928 1883 1932 1290 1935 1696 1936 1141 1937 1029 1937 1074 1938 479 1939 1038 1944 558 1944 1543 1944 1973 1945 1552 1947 587 1947 928 1953 782 1964 1292 1967 558 1968 1682 1969 735 1973 731 1974 559 1980 1263 1981 427 1981 1766 1985 629 1987 1441 1988 428 1997 560 2007 979 2009 1088 2009 1842 2012 1655 2015 563 2018 556 2022 1114 2028 491 2033 426 2034 811 2034 1371 2035 477 2035 1556 2039 1262 2040 719 2043 1782 2049 570 2051 540 2051 1095 2054 1782 2055 1736 2059 426 2060 987 2062 1720 2066 1745 2067 1199 2067 1731 2068 698 2071 1158 2072 1676 2074 1221 2077 541 2077 1821 2078 470 2080 1573 2083 1145 2087 480 2088 475 2088 559 2091 850 2091 944 2093 534 2095 451 2101 1929 2102 1298 2103 832 2105 550 2105 1249 2107 1435 2108 489 2111 985 2111 1511 2112 574 2113 1556 2115 1518 2117 918 2117 1955 2121 1631 2128 1528 2139 327 2139 1729 2140 334 2142 311 2142 490 2144 519 2152 328 2161 334 2161 1921 2163 546 2163 1214 2168 833 2171 1977 2174 491 2174 948 2175 351 2177 1467 2178 549 2179 970 2179 1693 2180 607 2182 1708 2183 586 2184 1023 2185 965 2186 675 2186 1126 2188 361 2188 374 2193 744 2206 680 2207 441 2210 672 2213 426 2215 586 2215 1495 2215 1871 2219 964 2222 1528 2223 1953 2226 686 2226 909 2227 710 2235 443 2235 2104 2239 1182 2239 1489 2240 586 2241 2182 2242 2118 2243 1034 2246 1415 2247 1944 2248 604 2248 2169 2249 704 2251 631 2252 787 2253 540 2253 673 2254 1330 2256 2040 2269 594 2270 1928 2272 609 2273 1548 2275 600 2275 707 2279 808 2283 1732 2283 1928 2286 1356 2288 1930 2290 1194 2295 1516 2297 1299 2297 1580 2298 1896 2298 1917 2298 1926 2302 1247 2306 528 2306 961 2310 1535 2313 671 2318 1064 2318 1914 2327 1464 2328 1134 2332 722 2336 1019 2348 1568 2353 787 2353 1887 2355 1447 2359 1331 2360 1337 2365 914 2373 1877 2379 1207 2379 1256 2380 1561 2387 1116 2390 698 2393 1527 2397 1397 2401 1825 2401 1858 2402 1111 2413 937 2413 1015 2417 956 2421 827 2428 1004 2435 931 2488 1764 2492 792 2505 1099 2506 817 2513 1199 2567 1152 2570 939 2581 947 2582 978 2586 1054 2587 1195 2588 988 2590 1619 2598 1161 2604 1594 2609 1581 2612 1220 2614 1559 2623 1114 2630 1214 2630 1248 2643 1150 2643 1222