AIDAhisto: Atlas-based imaging data analysis tool for mouse brain histology Number of identified Cells in 94 given ROIs 2 SSp-m6b 74 19 IG 10 36 GU1 152 72 ADP 4 81 VL 111 117 och 129 120 AIp1 152 129 V3 8 148 GU4 49 163 AIp2/3 98 180 GU2/3 191 187 GU5 34 211 ACAd2/3 213 226 LPO 16 250 LSc 291 258 LSr 871 263 AVP 8 272 AVPV 3 296 ACAv2/3 229 298 MA 43 314 AIp6a 17 320 MOp1 394 342 SI 74 344 AIp5 37 351 BST 172 450 SSp-ul1 236 452 MEPO 6 477 STR 473 523 MPO 15 558 SSp-n1 200 564 MS 118 577 SSp-ul4 271 583 CLA 55 588 ACAv1 246 596 NDB 109 625 SSp-ul5 421 638 GU6a 42 648 MOp5 1313 656 MOs1 191 657 SSp-m2/3 413 662 GU6b 1 665 lot 44 672 CP 9526 698 OLF 150 703 CTXsp 11 754 OT 240 763 OV 17 767 MOs5 281 772 ACAv5 163 776 cc 2190 803 PAL 162 806 SSs2/3 367 810 ACAv6a 125 819 ACAv6b 35 838 SSp-n2/3 551 844 MOp6a 1213 849 VISC6b 2 854 SSp-ul2/3 476 857 VISC6a 52 862 SSs6a 175 873 SSs1 250 878 SSp-m1 114 882 MOp6b 282 893 SSs6b 2 897 VISC1 106 900 aco 4 908 act 0 919 ACAd6a 57 927 ACAd6b 7 935 ACAd1 229 940 cing 194 943 MOp2/3 596 945 SSp-ul6a 246 950 SSp-m4 173 952 EPd 104 961 PIR 682 962 MOs2/3 371 974 SSp-m5 311 985 MOp 103 998 FS 35 1009 fiber tracts 157 1010 VISC4 89 1015 ACAd5 183 1021 MOs6a 135 1026 SSp-ul6b 14 1035 SSs4 126 1058 VISC5 88 1085 MOs6b 19 1090 SSs5 188 1097 HY 25 1102 SSp-m6a 979 1106 VISC2/3 119 1109 PS 3