AIDAhisto: Atlas-based imaging data analysis tool for mouse brain histology Number of identified Cells in 94 given ROIs 2 SSp-m6b 28 19 IG 5 36 GU1 46 72 ADP 0 81 VL 63 117 och 54 120 AIp1 70 129 V3 1 148 GU4 14 163 AIp2/3 25 180 GU2/3 52 187 GU5 10 211 ACAd2/3 63 226 LPO 5 250 LSc 159 258 LSr 307 263 AVP 4 272 AVPV 2 296 ACAv2/3 72 298 MA 10 314 AIp6a 5 320 MOp1 96 342 SI 9 344 AIp5 3 351 BST 50 450 SSp-ul1 81 452 MEPO 1 477 STR 162 523 MPO 0 558 SSp-n1 81 564 MS 42 577 SSp-ul4 119 583 CLA 13 588 ACAv1 115 596 NDB 40 625 SSp-ul5 206 638 GU6a 8 648 MOp5 719 656 MOs1 101 657 SSp-m2/3 80 662 GU6b 0 665 lot 21 672 CP 3955 698 OLF 42 703 CTXsp 3 754 OT 60 763 OV 8 767 MOs5 129 772 ACAv5 48 776 cc 1028 803 PAL 50 806 SSs2/3 97 810 ACAv6a 46 819 ACAv6b 12 838 SSp-n2/3 182 844 MOp6a 603 849 VISC6b 0 854 SSp-ul2/3 173 857 VISC6a 8 862 SSs6a 56 873 SSs1 101 878 SSp-m1 44 882 MOp6b 140 893 SSs6b 3 897 VISC1 40 900 aco 3 908 act 0 919 ACAd6a 13 927 ACAd6b 1 935 ACAd1 111 940 cing 88 943 MOp2/3 125 945 SSp-ul6a 112 950 SSp-m4 29 952 EPd 29 961 PIR 236 962 MOs2/3 123 974 SSp-m5 52 985 MOp 35 998 FS 9 1009 fiber tracts 80 1010 VISC4 23 1015 ACAd5 47 1021 MOs6a 47 1026 SSp-ul6b 3 1035 SSs4 22 1058 VISC5 14 1085 MOs6b 6 1090 SSs5 34 1097 HY 10 1102 SSp-m6a 333 1106 VISC2/3 28 1109 PS 0 182305696 6