 pgleeson
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12714a5420
Regenerated all nml cells with <spikeThresh>
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hace 3 meses |
 Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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bec135210b
fix(sst): set Ih explicitly on axon
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hace 11 meses |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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720c60a247
fix(pyr): explicitly set Ih for axon
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hace 11 meses |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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04686ca676
feat(neuroml): move addition of tonic inh to network creation script
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hace 1 año |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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7bca13afc5
feat(cells): add tonic inhibition
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hace 1 año |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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1e027db797
chore: lint/format with black
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hace 1 año |
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pgleeson
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e696972484
Helper script to generate and retest all cell models
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hace 1 año |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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38fe2a47ec
feat(cells): generate passive cell models
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hace 1 año |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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3b501f2fb4
chore: isort
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hace 1 año |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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eec9e302a6
feat: create new segment group that excludes myelin
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hace 1 año |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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6a6f284a97
feat(sst): correct conversion
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hace 1 año |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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dad103d914
feat(vip): correctly set initial calcium concentration
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hace 1 año |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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d80639ef4f
fix: use `InputList` instead of `ExplicitInput`
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hace 1 año |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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ac9e291d3e
feat: add test simulation for each cell
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hace 1 año |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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19a33bbe71
feat: completes VIP cell
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hace 1 año |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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ef702551fc
feat: complete SST conversion
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hace 1 año |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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3eba223a76
feat: PV + PYR look complete
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hace 1 año |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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42ce350544
feat: PYR looks done
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hace 1 año |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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391c546575
wip: postprocess
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hace 1 año |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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4cc26a3374
feat: optimise dendrite group for PYR cell
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hace 2 años |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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cacc67eef3
feat: add more channels to PYR (TODO: inhomogenous Ih)
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hace 2 años |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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1402caa7e1
wip: create apical and basal groups for PYR cell, add some biophys
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hace 2 años |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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463cc817f1
feat: tweak post processing to also plot hyperpolarising current
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hace 2 años |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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1f5ada03b6
fix: correct parameter values, move channel files to separate dir
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hace 2 años |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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65a2b62915
fix: passive ion channel should have `non_specific` ion
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hace 2 años |
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Padraig Gleeson
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9ad9c7d5b4
Fix ion capitals
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hace 2 años |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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bcd0b38faa
wip
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hace 2 años |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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23d870ac70
feat: morph looks fine, biophysics needs work
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hace 2 años |
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Ankur Sinha (Ankur Sinha Gmail)
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d8d276c417
wip: fixed morph issue using
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hace 2 años |
