mnetonix.py
 
Usage:
python mnetonix.py <datafile> <montage>
 
- datafile: Either an EDF file or a BrainVision header file (vhdr).
- montage: Any format montage file supported by MNE.
 
(Requires Python 3)
 
Command line script for reading EDF and BrainVision files using MNE
(mne-python) and storing the data and metadata into a NIX file.  Supports
reading montage files for recording channel locations.
 
NIX Format layout:
 
Data:
Raw Data are stored in either a single 2-dimensional DataArray or a collection
of DataArrays (one per recording channel).  The latter makes tagging easier
since MultiTag positions and extents don't need to specify every channel they
reference.  However, creating multiple DataArrays makes file sizes much
bigger.
 
Stimuli:
MNE provides stimulus information through the Raw.annotations dictionary.
Onsets correspond to the 'positions' array and durations correspond to the
'extents' array of the "Stimuli" MultiTag.
 
Metadata:
MNE collects metadata into a (nested) dictionary (Raw.info).  All non-empty
keys are converted into Properties in NIX.  The nested structure of the
dictionary is replicated in NIX by creating child Sections, starting with one
root section with name "Info".

Modules
		mne nixio numpy os matplotlib.pyplot sys

Functions
		create_md_tree(section, values) main() plot_channel(data_array, index) write_multi_da(mneraw, block) write_raw_mne(nfname, mneraw, split_data_channels=True) write_single_da(mneraw, block) write_stim_tags(mneraw, block)

Data
		RAW_DATA_TYPE = 'Raw Data'